RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CASC4	Q6P4E1	433 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	APBA2	Q99767	749 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	KRT82	Q9NSB4	513 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DTL	Q9NZJ0	730 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PLLP	Q9Y342	182 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	HES2	Q9Y543	173 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP3	Q9Y6I4	520 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	KAT6A	Q92794	2004 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408		C9IYK1	514 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408		M0QYT0	321 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MFSD11	O43934	449 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	AVIL	O75366	819 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALDH1A2	O94788	518 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	F9	P00740	461 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	POLB	P06746	335 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	GOT1	P17174	413 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	BGN	P21810	368 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CALB2	P22676	271 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	AMPD1	P23109	780 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PTPN4	P29074	926 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCSK1	P29120	753 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	HCAR3	P49019	387 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAB27A	P51159	221 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	GJA9	P57773	515 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	LILRA4	P59901	499 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TPI1	P60174	286 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADAM17	P78536	824 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMPRSS15	P98073	1019 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	AP1B1	Q10567	949 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MTM1	Q13496	603 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DCAF6	Q58WW2	860 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	RFX8	Q6ZV50	586 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF534	Q76KX8	674 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	RASSF3	Q86WH2	238 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM131B	Q86XD5	332 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NT5C3B	Q969T7	300 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	E2F7	Q96AV8	911 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NPY6R	Q99463	290 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	VAT1	Q99536	393 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SYT15	Q9BQS2	421 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	YY1AP1	Q9H869	796 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHST12	Q9NRB3	414 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLK14	Q9P0G3	267 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CDH9	Q9ULB4	789 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NME7	Q9Y5B8	376 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PSMD3	O43242	534 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	METTL18	O95568	372 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	IL2RA	P01589	272 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	C1QA	P02745	245 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CSH1	P0DML2	217 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CSH2	P0DML3	217 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ODC1	P11926	461 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	AKR1A1	P14550	325 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	LMO2	P25791	158 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms