RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ASIC4Q96FT7 647 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPINB11Q96P15 392 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GCNAQ96QF7 691 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TASP1Q9H6P5 420 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 WDCPQ9H6R7 721 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MPP6Q9NZW5 540 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CD207Q9UJ71 328 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NR2E1Q9Y466 385 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ANTXRLA6NF34 631 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MBTPS2O43462 519 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PSTPIP1O43586 416 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ACSL4O60488 711 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTN5O94779 1100 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 APOEP02649 317 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 IL9P15248 144 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TACR2P21452 398 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FCARP24071 287 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KDELR1P24390 212 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 IL4RP24394 825 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 L1CAMP32004 1257 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GBP1P32455 592 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PCK1P35558 622 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC1A1P43005 524 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf54Q08AI8 447 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DPYSL3Q14195 570 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 COL19A1Q14993 1142 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ALFQ53S48 1182 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL22Q6P050 247 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PARM1Q6UWI2 310 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.411e-6■■□□□ 11.4
CAPNS1-208ENST00000589162 BEND5Q7L4P6 421 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CHSY1Q86X52 802 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD6Q8NC69 237 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CALN1Q9BXU9 219 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PLK2Q9NYY3 685 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 STIM2Q9P246 746 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX12Q9UMY4 172 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NEU3Q9UQ49 428 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC66A2RUB6 948 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 E9PAM4 449 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF197O14709 1029 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM24O15164 1050 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD11O43934 449 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LRIG2O94898 1065 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ASGR2P07307 311 aa6.22□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 POU2F2P09086 479 aa6.22□□□□□ -1.41
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