RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD52P31358 61 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRIK3Q13003 919 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHI3L2Q15782 390 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAC4Q86UU9 113 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP57Q86XR8 500 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EDEM1Q92611 657 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DPF3Q92784 378 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CERS2Q96G23 380 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM62Q9BVG3 475 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GBA3Q9H227 469 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CASS4Q9NQ75 786 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.91■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYO16Q9Y6X6 1858 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEPT4O43236 478 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRIG2O94898 1065 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POMCP01189 267 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITGA2BP08514 1039 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYL2P10916 166 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP2C18P33260 490 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THPOP40225 353 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF33AQ06730 810 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRT72Q14CN4 511 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CES4AQ5XG92 561 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM135Q86UB9 458 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UROC1Q96N76 676 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCDC2Q9UHG0 476 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPP1O14773 563 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GSRP00390 522 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGLV3-25P01717 112 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BDNFP23560 247 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPHB2P29323 1055 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GP5P40197 560 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRCC3P46736 316 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TUSC3Q13454 348 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRTP1Q5TC63 336 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RASSF3Q86WH2 238 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP2A3Q93084 1043 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBC1D31Q96DN5 1066 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPNE1Q99829 537 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OSBPL2Q9H1P3 480 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BFARQ9NZS9 450 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFATQ9P243 1243 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSAT1Q9Y617 370 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP1O94782 785 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FCGRTP55899 365 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB17Q13105 803 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 E2F5Q15329 346 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INSCQ1MX18 579 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ISL2Q96A47 359 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AGAP3Q96P47 875 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EBF2Q9HAK2 575 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THAP1Q9NVV9 213 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EMCNQ9ULC0 261 aa16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC22O60826 627 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASGR1P07306 291 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB16Q05516 673 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SREBF2Q12772 1141 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OLIG2Q13516 323 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LPIN1Q14693 890 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LONP2Q86WA8 852 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM13CQ8NE31 585 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NSL1Q96IY1 281 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEKT5Q96M29 485 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TXNDC16Q9P2K2 825 aa16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms