RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CEP41	Q9BYV8	373 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	RNF181	Q9P0P0	153 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP6	O75344	327 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	NEBL	O76041	1014 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CPA3	P15088	417 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	COPA	P53621	1224 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SCAP	Q12770	1279 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	GRB14	Q14449	540 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SNX17	Q15036	470 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PANX3	Q96QZ0	392 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	RBBP8	Q99708	897 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SNX15	Q9NRS6	342 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	RNF19A	Q9NV58	838 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	COX16	Q9P0S2	106 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SIN3B	O75182	1162 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	USP1	O94782	785 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MPO	P05164	745 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CPOX	P36551	454 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MLH1	P40692	756 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	GPR142	Q7Z601	462 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM135	Q86UB9	458 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	OSTM1	Q86WC4	334 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SORT1	Q99523	831 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PIGV	Q9NUD9	493 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	FAM200B	P0CF97	657 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ANPEP	P15144	967 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN3	P26045	913 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LRPAP1	P30533	357 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	IDH3A	P50213	366 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	LIMK2	P53671	638 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	AAGAB	Q6PD74	315 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MED10	Q9BTT4	135 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	NDE1	Q9NXR1	346 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	AP3B1	O00203	1094 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PRKCG	P05129	697 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ERCC2	P18074	760 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TKTL1	P51854	596 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TPI1	P60174	286 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1J	Q5JR12	505 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	DCLK2	Q8N568	766 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	VAT1	Q99536	393 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	RNF39	Q9H2S5	420 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	CASS4	Q9NQ75	786 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	RRN3	Q9NYV6	651 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559		C9IYK1	514 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK1	O00180	336 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM44	O43615	452 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	HADHA	P40939	763 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFV1	P49821	464 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	GJA9	P57773	515 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	GSTA3	Q16772	222 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	FSCB	Q5H9T9	825 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	UBXN11	Q5T124	520 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	SCOC	Q9UIL1	159 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	MID2	Q9UJV3	735 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	IPP	Q9Y573	584 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RRN3-205	ENST00000563559		A0A088AWK7	358 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DPPA5	A6NC42	116 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM114	B3SHH9	223 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN5	O00501	218 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GABRD	O14764	452 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6

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