RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 CAMK4Q16566 473 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.68□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.68□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 ERICH2A1L162 156 aa5.67□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 GNA14O95837 355 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PNPP00491 289 aa5.67□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 ASLP04424 464 aa5.67□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 ANXA6P08133 673 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CLUP10909 449 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PRPS2P11908 318 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 AKT1P31749 480 aa5.67□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 ETV5P41161 510 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 DPP6P42658 865 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TECP42680 631 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 LIG3P49916 1009 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 GATMP50440 423 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 MAPK10P53779 464 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RAD23AP54725 363 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PRRX1P54821 245 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RPP30P78346 268 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 GCNT1Q02742 428 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 LIPEQ05469 1076 aa5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SCRN1Q12765 414 aa5.67□□□□□ -1.5
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