RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 LRIG2O94898 1065 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 L1CAMP32004 1257 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CCR3P51677 355 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ANGPT1Q15389 498 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SPA17Q15506 151 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CA9Q16790 459 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 EFHC2Q5JST6 749 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 USP18Q9UMW8 372 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TFR2Q9UP52 801 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SGK1O00141 431 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PRPSAP2O60256 369 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ADAM23O75077 832 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 MTA2O94776 668 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PROSCO94903 275 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 IL1R2P27930 398 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 GSDMDP57764 484 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SEMA3BQ13214 749 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TCEAL1Q15170 157 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 FUT11Q495W5 492 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 MBLAC2Q68D91 279 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TSSK4Q6SA08 328 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SYT13Q7L8C5 426 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 APCDD1Q8J025 514 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 AHI1Q8N157 1196 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 RFFLQ8WZ73 363 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TTC17Q96AE7 1141 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ALG14Q96F25 216 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CIPCQ9C0C6 399 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 NEU3Q9UQ49 428 aa20.88■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 WASH3PC4AMC7 463 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CSKP41240 450 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 WASP42768 502 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PLK1P53350 603 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TCF15Q12870 199 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 DMC1Q14565 340 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 UCMAQ8WVF2 138 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ACDQ96AP0 544 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PRRX2Q99811 253 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.87■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 RCCD1A6NED2 376 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 K7ESF4 209 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TDGF1P13385 188 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 NTSR1P30989 418 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 NUMBP49757 651 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC12A1Q13621 1099 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 MESDQ14696 234 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 BOLA3Q53S33 107 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 NLRP14Q86W24 1093 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNH6Q9H252 994 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 H0Y858 1186 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CREB3O43889 395 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SP9P0CG40 484 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 RHOQP17081 205 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 COL9A1P20849 921 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 MRE11P49959 708 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 OXCT1P55809 520 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF234Q14588 700 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PTPRNQ16849 979 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 EOGTQ5NDL2 527 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN3-207ENST00000559494 CHPFQ8IZ52 775 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms