RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	DDR2	Q16832	855 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FGF13	Q92913	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CLDN5	O00501	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF197	O14709	1029 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CAPN9	O14815	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PSPN	O60542	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	VNN1	O95497	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GNA14	O95837	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MBD3	O95983	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TPM2	P07951	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RHO	P08100	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CHRNB1	P11230	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PI3	P19957	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	BMP6	P22004	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ADORA2B	P29275	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR15	P49685	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NDST1	P52848	882 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PLD1	Q13393	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PLK5	Q496M5	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	KRT39	Q6A163	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM3C	Q92520	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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