RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 GRM4Q14833 912 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PKN1Q16512 942 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 AMOTQ4VCS5 1084 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 XKR9Q5GH70 373 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 EMC4Q5J8M3 183 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CES4AQ5XG92 561 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CTAGE6Q86UF2 777 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CEP57Q86XR8 500 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CTAGE4Q8IX94 777 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 SPACA3Q8IXA5 215 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 AFAP1Q8N556 730 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 SLC5A11Q8WWX8 675 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 WASF1Q92558 559 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PERPQ96FX8 193 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 ERO1AQ96HE7 468 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PGAM5Q96HS1 289 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 MAP6Q96JE9 813 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 NLRP4Q96MN2 994 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CD180Q99467 661 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 ACPTQ9BZG2 426 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 SLC32A1Q9H598 525 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 SEMA3GQ9NS98 782 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 TMEM140Q9NV12 185 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 HMG20BQ9P0W2 317 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 AMACRQ9UHK6 382 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 NSD2O96028 1365 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 UNC13AQ9UPW8 1703 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 LACTBL1A8MY62 500 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CTAGE5O15320 804 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 MAGEB3O15480 346 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 GPR32O75388 356 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 UNC5CO95185 931 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 OR2C1O95371 312 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 AMY1AP04745 511 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CFIP05156 583 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CD1AP06126 327 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 RB1P06400 928 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 GRPP07492 148 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 NEFHP12036 1026 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 COX7A2P14406 83 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PTPN3P26045 913 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 RDXP35241 583 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 RABIFP47224 123 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CAMLGP49069 296 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 CASP9P55211 416 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 UCP3P55916 312 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 UFM1P61960 85 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 OLR1P78380 273 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 NFATC3Q12968 1075 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 BNIP3Q12983 259 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 GPS1Q13098 491 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 IKZF1Q13422 519 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 HYAL4Q2M3T9 481 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 PROSER3Q2NL68 480 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CS-232ENST00000552331 ZNF766Q5HY98 468 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms