RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.49■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TAC1P20366 129 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PAX3P23760 479 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 GALNT2Q10471 571 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TAF10Q12962 218 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM60Q495X7 471 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF280DQ6N043 979 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SCML4Q8N228 414 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SCML2Q9UQR0 700 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FGFR3P22607 806 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 MROH9Q5TGP6 573 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 MON1AQ86VX9 555 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FERMT1Q9BQL6 677 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.48■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 MTMR11A4FU01 709 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PITPNM1O00562 1244 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 LIG3P49916 1009 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PSMD5Q16401 504 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CNTD1Q8N815 330 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FBXO32Q969P5 355 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 IL9RQ01113 521 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 GSDMBQ8TAX9 411 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.47■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SARNPP82979 210 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TEX44Q53QW1 395 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CGB2Q6NT52 195 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 BANPQ8N9N5 519 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 C8orf48Q96LL4 319 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 MAGEB18Q96M61 343 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 FETUBQ9UGM5 382 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 E9PAM4 449 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 TSHRP16473 764 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PRKCHP24723 683 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 YWHAQP27348 245 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CORO7P57737 925 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 RASA2Q15283 850 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CERCAMQ5T4B2 595 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 HHATQ5VTY9 493 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 DNAAF3Q8N9W5 541 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 HDAC11Q96DB2 347 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SGSM3Q96HU1 749 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.46■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 HMX2A2RU54 273 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 COL6A1P12109 1028 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 HAPLN3Q96S86 360 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 PSAT1Q9Y617 370 aa21.45■■□□□ 1.03
PRDM4-205ENST00000550376 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 ATP9BO43861 1147 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 SPAG6O75602 509 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 CNTN5O94779 1100 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 KIAA0754O94854 1291 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 ERVK-10P10266 1014 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 MX2P20592 715 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 SERPINB6P35237 376 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC39Q96DD0 335 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 PPCSQ9HAB8 311 aa21.45■■□□□ 1.02
PRDM4-205ENST00000550376 SENP1Q9P0U3 644 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms