RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125		F8W810	466 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	GRM8	O00222	908 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SEPT4	O43236	478 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TLR2	O60603	784 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	FGB	P02675	491 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	CYP21A2	P08686	494 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	CIITA	P33076	1130 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PLCD1	P51178	756 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ADPRH	P54922	357 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ARL4C	P56559	192 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	CDK18	Q07002	472 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	C10orf25	Q5T742	122 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	DEF8	Q6ZN54	512 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ATP2A3	Q93084	1043 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SCLT1	Q96NL6	688 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	NPAS1	Q99742	590 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RCE1	Q9Y256	329 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PCSK5	Q92824	1860 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	CHN1	P15882	459 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RXRA	P19793	462 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	MCM2	P49736	904 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ACTR2	P61160	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	GALNT3	Q14435	633 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PGM5	Q15124	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	CLPB	Q9H078	707 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PPEF2	O14830	753 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TK1	P04183	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PRPH2	P23942	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	OAZ1	P54368	228 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	IP6K1	Q92551	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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