RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543470.5

RPS6KC1-207, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-207ENST00000543470 E5RJQ4 531 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 TMCC1O94876 653 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 OSMRQ99650 979 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 MUC3BQ9H195 1237 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
RPS6KC1-207ENST00000543470 WDR27A2RRH5 827 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC25A27O95847 323 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MGAT1P26572 445 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC1A6P48664 564 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SERPINB8P50452 374 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PLD3Q8IV08 490 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PMM2O15305 246 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MAP3K7CLP57077 242 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 VEPH1Q14D04 833 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 FBXL18Q96ME1 805 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 EBF3Q9H4W6 596 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GPAMQ9HCL2 828 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 IRF1P10914 325 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 INSRRP14616 1297 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 LINC00523Q86TU6 105 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 LZICQ8WZA0 190 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 FAM162AQ96A26 154 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 A0A096LPK6 155 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TBC1D4O60343 1298 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 APOA4P06727 396 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GJB1P08034 283 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 BCAT1P54687 386 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 P3H2Q8IVL5 708 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PNPOQ9NVS9 261 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PLLPQ9Y342 182 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 FKBP6O75344 327 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 NEK2P51955 445 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RTP1P59025 263 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CDC42EP1Q00587 391 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 KYQ8NBH2 561 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MPP4Q96JB8 637 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 THAP1Q9NVV9 213 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PHLPP1O60346 1717 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 NR5A2O00482 541 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TM7SF2O76062 418 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 BAIAP3O94812 1187 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 SERPIND1P05546 499 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PKNOX1P55347 436 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TGFB2P61812 414 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRIM60Q495X7 471 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 MIER2Q8N344 545 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GP5P40197 560 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 STYK1Q6J9G0 422 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 RELL1Q8IUW5 271 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 CDRT15Q96T59 188 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS6KC1-207ENST00000543470 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms