RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522336.5

CPEB4-209, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CPEB4, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-209ENST00000522336 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 TACR2P21452 398 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 CCNCP24863 283 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 IRS1P35568 1242 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 HSD17B3P37058 310 aa8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 SLC7A9P82251 487 aa8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 KCNJ11Q14654 390 aa8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 SPRED2Q7Z698 418 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 CHSY1Q86X52 802 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 LEMD2Q8NC56 503 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 CCNYQ8ND76 341 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 FATE1Q969F0 183 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 P2RY11Q96G91 374 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ASAH2Q9NR71 780 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 F5H5T6 163 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 XYLBO75191 536 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 PAPLNO95428 1278 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 NUDT17P0C025 328 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 PTPN2P17706 415 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 HDCP19113 662 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 TPSB2P20231 275 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 CHKAP35790 457 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 NRLP54845 237 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 BASP1P80723 227 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 TPSAB1Q15661 275 aa8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.69□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 IGSF8Q969P0 613 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 EXOC4Q96A65 974 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ZIM3Q96PE6 472 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 PBX4Q9BYU1 374 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 MED4Q9NPJ6 270 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 OGFRQ9NZT2 677 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 MPP6Q9NZW5 540 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 MSRAQ9UJ68 235 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.68□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.68□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 AGPSO00116 658 aa8.68□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 RNF103O00237 685 aa8.68□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 MATN3O15232 486 aa8.68□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ALOX15BO15296 676 aa8.68□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 RIPK2O43353 540 aa8.68□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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CPEB4-209ENST00000522336 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 ARL4CP56559 192 aa8.68□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CPEB4-209ENST00000522336 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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