RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 KCNK1O00180 336 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ITGAVP06756 1048 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NUDT17P0C025 328 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GOT1P17174 413 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ACADVLP49748 655 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 IL9RQ01113 521 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CRY1Q16526 586 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LGSNQ5TDP6 509 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 OSTM1Q86WC4 334 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINB12Q96P63 405 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP16Q9BY84 665 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MUC3BQ9H195 1237 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 WDCPQ9H6R7 721 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PDP2Q9P2J9 529 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 Q9Y3F1 56 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SCN1AP35498 2009 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC78A2IDD5 438 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TNFRSF10AO00220 468 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HPCAP84074 193 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GBE1Q04446 702 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DPYSL3Q14195 570 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 E2F2Q14209 437 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SEC14L1Q92503 715 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PCED1BQ96HM7 432 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PEBP4Q96S96 227 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TRABDQ9H4I3 376 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 RNF186Q9NXI6 227 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SQORQ9Y6N5 450 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 WDR81Q562E7 1941 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PIRO00625 290 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SAT1P21673 171 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MATKP42679 507 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GJA9P57773 515 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 IRX4P78413 519 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ITKQ08881 620 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NXNQ6DKJ4 435 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TRPV1Q8NER1 839 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PGM2Q96G03 612 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 GGT7Q9UJ14 662 aa8.05□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 PTGESO14684 152 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC3O43617 180 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 SNX2O60749 519 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 AVILO75366 819 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 LTFP02788 710 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 OR4Q2P0C623 313 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 KCNE1P15382 129 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ACADSP16219 412 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 NOS2P35228 1153 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ELK3P41970 407 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB16Q05516 673 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPS1-208ENST00000519076 FAM35AQ86V20 835 aa8.04□□□□□ -1.12
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