RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518928.1

TSNARE1-203, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-203ENST00000518928 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 USP24Q9UPU5 2620 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 KRT37O76014 449 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ACSL1P33121 698 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CSKP41240 450 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC6A3Q01959 620 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CENPCQ03188 943 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 LAYNQ6UX15 382 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 BEND5Q7L4P6 421 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 XYLT1Q86Y38 959 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 DEFB106AQ8N104 65 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 GOLGA1Q92805 767 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 C18orf8Q96DM3 657 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SERPINB11Q96P15 392 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 NUP58Q9BVL2 599 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SYNCQ9H7C4 482 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 IL21RQ9HBE5 538 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.63□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 AKAP13Q12802 2813 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 A0A1W2PQJ5 194 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 TTC34A8MYJ7 566 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 NDUFS2O75306 463 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 GLI1P08151 1106 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SERPINF2P08697 491 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 VAV1P15498 845 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 TACR2P21452 398 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC11A2P49281 568 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 METAP1P53582 386 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 PIP4P1Q86T03 277 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 AHI1Q8N157 1196 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 OR2T3Q8NH03 318 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.62□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ARHGAP33O14559 1287 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CAPN9O14815 690 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 HSF2BPO75031 334 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SIN3BO75182 1162 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 GJB3O75712 270 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 IGLV3-19P01714 112 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 GYPCP04921 128 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CCDC172P0C7W6 258 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SKILP12757 684 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CD59P13987 128 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 MMP8P22894 467 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SNX16P57768 344 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 PTP4A2Q12974 167 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 SEMA3BQ13214 749 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 NNTQ13423 1086 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ASIC2Q16515 512 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 RAB6CQ53S08 254 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 MPP7Q5T2T1 576 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ARTNQ5T4W7 220 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 TRNP1Q6NT89 227 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 C14orf80Q86SX3 495 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 CHSY1Q86X52 802 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 FIBINQ8TAL6 211 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.61□□□□□ -0.07
TSNARE1-203ENST00000518928 IGSF8Q969P0 613 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms