RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517650.1

IGHVIII-67-3-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (III)-67-3 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVIII-67-3, Length 232 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.45□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.45□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 SQORQ9Y6N5 450 aa8.45□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CCDC189A1A4V9 331 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 WDR91A4D1P6 747 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PDHXO00330 501 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 MFSD11O43934 449 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TRIM13O60858 407 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 AVILO75366 819 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ANXA9O76027 345 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CYP11A1P05108 521 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 RALBP11234 206 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CPA3P15088 417 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 GOT1P17174 413 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CYP2B6P20813 491 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TYK2P29597 1187 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CPOXP36551 454 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 SLC26A3P40879 764 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 RAB27AP51159 221 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 AQP5P55064 265 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PDE1BQ01064 536 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 SATB1Q01826 763 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PPARDQ03181 441 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TNK2Q07912 1038 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TUBB3Q13509 450 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PRKG1Q13976 671 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 HIC1Q14526 733 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 NAA25Q14CX7 972 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 POTEHQ6S545 545 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ZNF567Q8N184 647 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CCDC185Q8N715 623 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CCDC126Q96EE4 140 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 FAR2Q96K12 515 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TEKT5Q96M29 485 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 UROC1Q96N76 676 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 FCRL5Q96RD9 977 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 HAPLN3Q96S86 360 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 KCNK16Q96T55 309 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 GPR22Q99680 433 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 RTKNQ9BST9 563 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PDP2Q9P2J9 529 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 EMCNQ9ULC0 261 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.44□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 DYTNA2CJ06 578 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 A8MUI8 341 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 WASH4PA8MWX3 477 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 M0QYT0 321 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CYB561D2O14569 222 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ZNF195O14628 629 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 TPP1O14773 563 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CAPN9O14815 690 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 INPPL1O15357 1258 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 MAP3K7O43318 606 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ENTPD5O75356 428 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 GRAP2O75791 330 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 IGLV3-25P01717 112 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ZNF286BP0CG31 522 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ERCC2P18074 760 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PTPN3P26045 913 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 GJA5P36382 358 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PSMC4P43686 418 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 PSEN2P49810 448 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 COPAP53621 1224 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 ADIGQ0VDE8 80 aa8.43□□□□□ -1.06
IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 CDH17Q12864 832 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms