RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A32Q9H2D1 315 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVK-5Q9HDB9 667 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXO4Q9UKT5 387 aa1.12□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EXTL3O43909 919 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRLF1O75462 422 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMBPP02760 352 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRAFP15056 766 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNLYP22749 145 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC5A2P31639 672 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATICP31939 592 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DGKQP52824 942 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMPRSS3P57727 454 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHC2P98077 582 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB16Q05516 673 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACSM2AQ08AH3 577 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMPCAQ10713 525 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC39A14Q15043 492 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNGA2Q16280 664 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LPAL2Q16609 132 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMS2CLQ68D20 193 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C9orf139Q6ZV77 190 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPH2Q8IWU9 490 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A41Q8N5S1 370 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KBTBD3Q8NAB2 608 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM216AQ8WUB2 273 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLMPQ8WWB7 406 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SORCS1Q8WY21 1168 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPIPB3Q92617 1050 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHMP4CQ96CF2 233 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOOK2Q96ED9 719 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRGUKQ96M69 825 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL17FQ96PD4 163 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DUX5Q96PT3 197 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EGFL8Q99944 293 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B3GNT4Q9C0J1 378 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL31Q9H511 634 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF696Q9H7X3 374 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPC25Q9HBM1 224 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RXFP3Q9NSD7 469 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM248Q9NWD8 314 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPEF1Q9Y4P9 236 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa1.11□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC34A8MYJ7 566 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALG1L2C9J202 215 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MS4A18H0YCH9 400 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRS3O43559 492 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNJ13O60928 360 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFATC1O95644 943 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT-ND5P03915 603 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MST1P26927 711 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP3CCP48454 512 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMTP48728 403 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRWD1-AS2P59051 145 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMO4P61968 165 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DSC1Q08554 894 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST3GAL1Q11201 340 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEMA3BQ13214 749 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FSCBQ5H9T9 825 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RRAGBQ5VZM2 374 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MZT2AQ6P582 158 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF497Q6ZNH5 498 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT28Q7Z3Y7 464 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB46Q86UZ6 589 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPHX4Q8IUS5 362 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM217AQ8IXS0 508 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YAF2Q8IY57 180 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAGSQ8N159 534 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCP11L2Q8N4U5 519 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM47BQ8NA70 645 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POC1AQ8NBT0 407 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF114Q8NC26 417 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR14A16Q8NHC5 309 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RUNDC1Q96C34 613 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCRS1Q96EZ8 462 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCMH1Q96GD3 660 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM2Q9C040 744 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMP28Q9H239 520 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM60Q9H2L4 133 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FSCN3Q9NQT6 498 aa1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms