RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 THAP9Q9H5L6 903 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 TJP2Q9UDY2 1190 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 BTBD3Q9Y2F9 522 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CEP83Q9Y592 693 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PP55 124 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 TAF4O00268 1085 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 MID1O15344 667 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 IGLV3-25P01717 112 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CAPNS1P04632 268 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SLC9A1P19634 815 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 USP8P40818 1118 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 NUMBP49757 651 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 GALCP54803 685 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ECT2LQ008S8 904 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 APBA1Q02410 837 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SCAPQ12770 1279 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PDCLQ13371 301 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 TRIM65Q6PJ69 517 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 BTN2A3PQ96KV6 586 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CDC6Q99741 560 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 NEUROG2Q9H2A3 272 aa17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP17.49■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 BECN2A8MW95 431 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 KCNU1A8MYU2 1149 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 F5H5T6 163 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 H0Y8X5 98 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SLC8A1P32418 973 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CTSKP43235 329 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP44Q17R89 818 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 WDTC1Q8N5D0 677 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 IGSF8Q969P0 613 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 FAM129BQ96TA1 746 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 OMDQ99983 421 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 FAM204AQ9H8W3 233 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 TOR4AQ9NXH8 423 aa17.48■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ITIH6Q6UXX5 1313 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PPC4 97 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8CPA6NN73 597 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PSMD8P48556 350 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 STK19P49842 368 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CCT8P50990 548 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PROSER1Q86XN7 944 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 DEFB106AQ8N104 65 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 STK40Q8N2I9 435 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PTPRN2Q92932 1015 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 FAM81BQ96LP2 452 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A18Q96N87 628 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CPXM1Q96SM3 734 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 EBF2Q9HAK2 575 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 COX16Q9P0S2 106 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 RWDD2AQ9UIY3 292 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 FZD4Q9ULV1 537 aa17.47■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ZZEF1O43149 2961 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 TMEM131Q92545 1883 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 LRRC72A6NJI9 287 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PCDHGA12O60330 932 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 GRAP2O75791 330 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PDGFRAP16234 1089 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 C21orf59P57076 290 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CDK17Q00537 523 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 IL9RQ01113 521 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ12Q14500 433 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CAMK4Q16566 473 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 GBP6Q6ZN66 633 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PASD1Q8IV76 773 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 AADATQ8N5Z0 425 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 OR2T34Q8NGX1 318 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 DDIT4Q9NX09 232 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SPEGQ15772 3267 aa17.46■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 KNL1Q8NG31 2342 aa17.46■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 VILLO15195 856 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 DKK1O94907 266 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 IL1BP01584 269 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 GLI1P08151 1106 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A3P11169 496 aa17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms