RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACUL1	Q86Y37	369 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDEM2	Q9BV94	578 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPEG	Q15772	3267 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GVM2	712 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIN3B	O75182	1162 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENDOD1	O94919	500 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	GJB6	O95452	261 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASL	P04424	464 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPM2	P07951	284 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	STAT1	P42224	750 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUMB	P49757	651 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLK1	P53350	603 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARID5A	Q03989	594 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQCB1	Q15051	598 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARC	Q7LC44	396 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	C10orf142	B7Z368	130 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0Y626	953 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNTN5	O94779	1100 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXD12	P35452	270 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALF	Q53S48	1182 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	EMC1	Q8N766	993 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	BAP1	Q92560	729 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF34	Q969K3	372 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR174	Q9BXC1	333 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	DRGX	A6NNA5	263 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	VAV1	P15498	845 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAOB	P27338	520 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACSL1	P33121	698 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	ECT2L	Q008S8	904 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTA1	Q13330	715 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC12A1	Q13621	1099 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPM1J	Q5JR12	505 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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