RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 BPGMP07738 259 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 HDAC4P56524 1084 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TCEAL1Q15170 157 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 EFHBQ8N7U6 833 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 C12orf42Q96LP6 360 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 AK5Q9Y6K8 562 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 STBD1O95210 358 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 LTFP02788 710 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TPBGLP0DKB5 382 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ACADSP16219 412 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 STMN1P16949 149 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 NPR3P17342 541 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 GRK2P25098 689 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 NOS2P35228 1153 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 MATKP42679 507 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PARP6Q2NL67 630 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ULK2Q8IYT8 1036 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TINF2Q9BSI4 451 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM8A1Q9UBU6 413 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TREHO43280 583 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP6AP2O75787 350 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF235Q14590 738 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 RALGPS1Q5JS13 557 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC39Q96DD0 335 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 AGAP2Q99490 1192 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 EFHD1Q9BUP0 239 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM216Q9P0N5 145 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SCN9AQ15858 1988 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 MFSD10Q14728 455 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR60Q8WVS4 1066 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 NDNQ99608 321 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PIF1Q9H611 641 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SNX15Q9NRS6 342 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 APPL1Q9UKG1 709 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 LRCH1Q9Y2L9 728 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 UTRNP46939 3433 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TYROBPO43914 113 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 RAG1P15918 1043 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 MAXP61244 160 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SYPL2Q5VXT5 272 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP2R1Q6VVX0 501 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 OTOP3Q7RTS5 596 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 VCX3AQ9NNX9 186 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 VTA1Q9NP79 307 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC167Q9P0B6 97 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 TIMM44O43615 452 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PEX1O43933 1283 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PIRTP0C851 137 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 UGP2Q16851 508 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ANO4Q32M45 955 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 LPCAT4Q643R3 524 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 BBS5Q8N3I7 341 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA22Q8NHS9 363 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC26Q8NHZ8 85 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 URGCPQ8TCY9 931 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 CRYL1Q9Y2S2 319 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 DTNAQ9Y4J8 743 aa13.07□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ADGRA2Q96PE1 1338 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 CLGNO14967 610 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 AKAP10O43572 662 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms