RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	SYCE3	A1L190	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ASAP2	O43150	1006 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	EDIL3	O43854	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CREB3	O43889	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NBN	O60934	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ITGA10	O75578	1167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CXCL10	P02778	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GHR	P10912	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	OSM	P13725	252 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GYPE	P15421	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PTH2R	P49190	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	UBE2H	P62256	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FOXI1	Q12951	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PDIA5	Q14554	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LXN	Q9BS40	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GABRD	O14764	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	STX6	O43752	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RECQL4	O94761	1208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SLITRK3	O94933	977 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	C22orf31	O95567	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CHRNA1	P02708	482 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	VTN	P04004	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SYT1	P21579	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MUT	P22033	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RPA1	P27694	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PRPH	P41219	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GPR3	P46089	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CLCN3	P51790	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TERF1	P54274	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	WNT3A	P56704	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KRT85	P78386	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NHLH2	Q02577	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TFDP1	Q14186	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MLC1	Q15049	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	UGCG	Q16739	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ANO5	Q75V66	913 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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