RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	CHST12	Q9NRB3	414 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	VPS45	Q9NRW7	570 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM170A	A1A519	330 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672		B4DGG1	531 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ERLIN1	O75477	346 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	BAIAP3	O94812	1187 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	WDR47	O94967	919 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	GYS1	P13807	737 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PRPH	P41219	470 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	UBXN2A	P68543	259 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	NUCB2	P80303	420 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	B4GALNT1	Q00973	533 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ZBTB17	Q13105	803 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	GPR162	Q16538	588 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	MANEA	Q5SRI9	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	CFAP58	Q5T655	872 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM57B	Q71RH2	274 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	TEX9	Q8N6V9	391 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PIGK	Q92643	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FCRL5	Q96RD9	977 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SMTNL1	A8MU46	457 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	VSTM5	A8MXK1	200 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	TTC34	A8MYJ7	566 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SMC2	O95347	1197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	MYL1	P05976	194 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	HTR7	P34969	479 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	THBS3	P49746	956 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC12A2	P55011	1212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	UBASH3A	P57075	661 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	MTAP	Q13126	283 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	GBX1	Q14549	363 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	GRM3	Q14832	879 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ACOX1	Q15067	660 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	CNGA3	Q16281	694 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ALF	Q53S48	1182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	HHAT	Q5VTY9	493 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	IRGC	Q6NXR0	463 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PACS1	Q6VY07	963 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	UEVLD	Q8IX04	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	KRT222	Q8N1A0	295 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	ARL10	Q8N8L6	244 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	NEK1	Q96PY6	1258 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SERINC2	Q96SA4	455 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SH3GL1	Q99961	368 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCDC66-222	ENST00000494672	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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