RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CNGB3Q9NQW8 809 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 VPS51Q9UID3 782 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NFAT5O94916 1531 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 A0A087X1B8 175 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 VPS4BO75351 444 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 BMP6P22004 513 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SPATA20Q8TB22 786 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SUSD6Q92537 303 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MYLPFQ96A32 169 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZYG11BQ9C0D3 744 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CHST7Q9NS84 486 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TGFB1I1O43294 461 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MMP3P08254 477 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ICAM3P32942 547 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 FLT3LGP49771 235 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NOMO3P69849 1222 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 RASA2Q15283 850 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CES5AQ6NT32 575 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TRIM69Q86WT6 500 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 OR5B17Q8NGF7 314 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 OR56A4Q8NGH8 313 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 RIN3Q8TB24 985 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 BAP1Q92560 729 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 REPS1Q96D71 796 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MPP6Q9NZW5 540 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PCYOX1Q9UHG3 505 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 B4GALT4O60513 344 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 USP2O75604 605 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 GJB6O95452 261 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SSTR1P30872 391 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NR6A1Q15406 480 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SCUBE1Q8IWY4 988 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 JADE3Q92613 823 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 RNF157Q96PX1 679 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 RXFP1Q9HBX9 757 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PARNO95453 639 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ERVK-10P10266 1014 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PCNAP12004 261 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 KCNA3P22001 575 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ACOX1Q15067 660 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 GALNT4Q8N4A0 578 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MYO5BQ9ULV0 1848 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 A0A0B4J269 797 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 APOA1P02647 267 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ATP4AP20648 1035 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PALB2Q86YC2 1186 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 STK39Q9UEW8 545 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 YDJCA8MPS7 323 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZW10O43264 779 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 HDCP19113 662 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SLC1A6P48664 564 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZNF844Q08AG5 666 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 EEF1DP3Q658K8 133 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 VPS50Q96JG6 964 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TAS2R14Q9NYV8 317 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DAB1O75553 588 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TUSC3Q13454 348 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 FUT11Q495W5 492 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SERAC1Q96JX3 654 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ACOX2Q99424 681 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PARVBQ9HBI1 364 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TCF7L2Q9NQB0 619 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DARSP14868 501 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TKTP29401 623 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ARSHQ5FYA8 562 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PHF21AQ96BD5 680 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 THAP11Q96EK4 314 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 HAO1Q9UJM8 370 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SNTNA6NMZ2 147 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 BTBD19C9JJ37 291 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 KATNA1O75449 491 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SLURP2P0DP57 97 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MAGEC3Q8TD91 643 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TCP10LQ8TDR4 215 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DUSP16Q9BY84 665 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PLIN4Q96Q06 1357 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms