RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 DMWDQ09019 674 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ZNF234Q14588 700 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 FUT11Q495W5 492 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 FSCBQ5H9T9 825 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 EFHC2Q5JST6 749 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ANO7Q6IWH7 933 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 C14orf80Q86SX3 495 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 RASSF3Q86WH2 238 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CCDC42Q96M95 316 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ACOX2Q99424 681 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.12■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SRGAP2O75044 1071 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 RNF8O76064 485 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 GGCXP38435 758 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CSKP41240 450 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PLK1P53350 603 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ACAP1Q15027 740 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 KDM1BQ8NB78 822 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 THAP2Q9H0W7 228 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 EPC1Q9H2F5 836 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.11■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 A0A1W2PQF6 199 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CYP1A2P05177 515 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 IL12RB1P42701 662 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 WASP42768 502 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ST8SIA6P61647 398 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 OGDHQ02218 1023 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 RAB6CQ53S08 254 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CCDC185Q8N715 623 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 HMGB4Q8WW32 186 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 GAB3Q8WWW8 586 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 NENFQ9UMX5 172 aa21.1■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 DMDP11532 3685 aa21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PTPRNQ16849 979 aa21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 C11orf74Q86VG3 221 aa21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 RAB23Q9ULC3 237 aa21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.09■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PIEZO1Q92508 2521 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CNTN5O94779 1100 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 EPHX1P07099 455 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 OR1E1P30953 314 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 L1CAMP32004 1257 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 HTR7P34969 479 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 NNMTP40261 264 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 IRAK1P51617 712 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 GALCP54803 685 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ECT2LQ008S8 904 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ALFQ53S48 1182 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 MANEALQ5VSG8 457 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PGBD3Q8N328 593 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 TC2NQ8N9U0 490 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 PHOX2BQ99453 314 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 EPAS1Q99814 870 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 NUP85Q9BW27 656 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 MUC3BQ9H195 1237 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 TMEM245Q9H330 911 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 FBRSQ9HAH7 460 aa21.08■□□□□ 0.97
NOM1-208ENST00000489850 CD248Q9HCU0 757 aa21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms