RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 MYL4P12829 197 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 EPCAMP16422 314 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 CHKAP35790 457 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 PMS2P54278 862 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP14Q86W24 1093 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA13Q96N96 652 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 SMPD4Q9NXE4 827 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 DPP7Q9UHL4 492 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 CHD9Q3L8U1 2897 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 MYO7AQ13402 2215 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA6BA6NDN3 693 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 DRGXA6NNA5 263 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 DFFAO00273 331 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 RFPL2O75678 378 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 OLFM2O95897 454 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 HOXA9P31269 272 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 CYP4F8P98187 520 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 RAB30Q15771 203 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 SPDYCQ5MJ68 293 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 IGSF8Q969P0 613 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 SLC22A12Q96S37 553 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM248Q9NWD8 314 aa27.53■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 OPHN1O60890 802 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
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HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 PPP2R2DQ66LE6 453 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 LGI2Q8N0V4 545 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 NAT8LQ8N9F0 302 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 NDFIP2Q9NV92 336 aa27.52■■■□□ 2
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PRU2 124 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 PER2O15055 1255 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 FGF19O95750 216 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 KLKB1P03952 638 aa27.51■■□□□ 1.99
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HOXB3-210ENST00000489475 ZNF33AQ06730 810 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 GPS2Q13227 327 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 ALFQ53S48 1182 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 ATPAF2Q8N5M1 289 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 MAB21L3Q8N8X9 362 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 NUP205Q92621 2012 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 KCNK1O00180 336 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 CNTN5O94779 1100 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 PTPN2P17706 415 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 FAM182AQ5T1J6 154 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD22Q5VYY1 191 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 AFMIDQ63HM1 303 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC49Q8IUZ0 686 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC13Q8IYE1 715 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 IQCKQ8N0W5 287 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa27.51■■□□□ 1.99
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HOXB3-210ENST00000489475 SLC39A8Q9C0K1 460 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 CHADO15335 359 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 XYLBO75191 536 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 CKMP06732 381 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 NDST2P52849 883 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 FAM193AP78312 1265 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 WASHC5Q12768 1159 aa27.5■■□□□ 1.99
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HOXB3-210ENST00000489475 ARNTL2Q8WYA1 636 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 TSGA13Q96PP4 275 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.993e-7■■■■□ 23.5
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HOXB3-210ENST00000489475 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa27.5■■□□□ 1.99
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HOXB3-210ENST00000489475 ADGRF1Q5T601 910 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 RFWD3Q6PCD5 774 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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HOXB3-210ENST00000489475 ETNK1Q9HBU6 452 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 SPDYE4A6NLX3 237 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA8MH3BSY2 632 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 PFKLP17858 780 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 CCNCP24863 283 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 EPHA5P54756 1037 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 KCNJ11Q14654 390 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXB3-210ENST00000489475 C5orf22Q49AR2 442 aa27.48■■□□□ 1.99
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