RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNJ18B7U540 433 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 THAP12O43422 761 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFSF14O43557 240 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 FBXO21O94952 628 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 LTFP02788 710 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF883P0CG24 379 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 JUPP14923 745 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PON1P27169 355 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GNA15P30679 374 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GPD2P43304 727 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ACADSBP45954 432 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 DGKGP49619 791 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 RHDQ02161 417 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 APBA1Q02410 837 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NFATC3Q12968 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 C4orf17Q53FE4 359 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 EOGTQ5NDL2 527 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GJB7Q6PEY0 223 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 DENND1CQ8IV53 801 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CPXM2Q8N436 756 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SHC3Q92529 594 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 EDEM1Q92611 657 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA1Q92805 767 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NXPE2Q96DL1 559 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CDC6Q99741 560 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NDST4Q9H3R1 872 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PLXNA2O75051 1894 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1B0GTW7 788 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1B0GVT2 93 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 BECN2A8MW95 431 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PIK3R2O00459 728 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 LATS1O95835 1130 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CYBBP04839 570 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CISD3P0C7P0 127 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CR2P20023 1033 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 USP8P40818 1118 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 MATKP42679 507 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 IL9RQ01113 521 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNJ12Q14500 433 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 VWA3BQ502W6 1294 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 MIIPQ5JXC2 388 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 FYB2Q5VWT5 728 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 LAYNQ6UX15 382 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 GPT2Q8TD30 523 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 STK32AQ8WU08 396 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 BHMTQ93088 406 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 MIS12Q9H081 205 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SIX2Q9NPC8 291 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ST7Q9NRC1 585 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PLK2Q9NYY3 685 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 FBXO10Q9UK96 956 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 RAD54BQ9Y620 910 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 NF1P21359 2839 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDSPL-208ENST00000486978 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms