RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 LGI2Q8N0V4 545 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 AZIN2Q96A70 460 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SERPINB11Q96P15 392 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CRACR2AQ9BSW2 395 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 BTBD1Q9H0C5 482 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TLR6Q9Y2C9 796 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FAM221BA6H8Z2 402 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA8CPA6NN73 597 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TTC34A8MYJ7 566 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MID1O15344 667 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 THAP12O43422 761 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CAPNS1P04632 268 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MARSP56192 900 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TPM4P67936 248 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IL9RQ01113 521 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ12Q14500 433 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GANCQ8TET4 914 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ZNF606Q8WXB4 792 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ORAI3Q9BRQ5 295 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PCED1AQ9H1Q7 454 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 EBF2Q9HAK2 575 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TOR4AQ9NXH8 423 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SUN2Q9UH99 717 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ERVW-1Q9UQF0 538 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FAM208BQ5VWN6 2430 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PP55 124 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CAPN9O14815 690 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IGHV4-34P06331 123 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 VAV1P15498 845 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SLC9A1P19634 815 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TACR2P21452 398 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GNA15P30679 374 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ST8SIA6P61647 398 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB16Q05516 673 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CDH18Q13634 790 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 KRT31Q15323 416 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP44Q17R89 818 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TCP11X2Q5H9J9 407 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 C9orf64Q5T6V5 341 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 NCEH1Q6PIU2 408 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CHSY1Q86X52 802 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FAM114A1Q8IWE2 563 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 RHBDD1Q8TEB9 315 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 NEUROG2Q9H2A3 272 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FBRSQ9HAH7 460 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FBXL12Q9NXK8 326 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ITPR1Q14643 2758 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 H0Y8X5 98 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PLK4O00444 970 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 WNT9AO14904 365 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GNA14O95837 355 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IGLV3-25P01717 112 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ZNF883P0CG24 379 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CD27P26842 260 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 USP8P40818 1118 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ACADSBP45954 432 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PSMD8P48556 350 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GALCP54803 685 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FANCCQ00597 558 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SCAPQ12770 1279 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 NNTQ13423 1086 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CST6Q15828 149 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0895LQ68EN5 471 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IL27RAQ6UWB1 636 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 DBX2Q6ZNG2 339 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 GLRX5Q86SX6 157 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TMEM110Q86TL2 294 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms