RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TSPAN3	O60637	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	NUDT3	O95989	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TGM2	P21980	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	NR1H2	P55055	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PROK1	P58294	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MTA1	Q13330	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RALBP1	Q15311	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	GPR162	Q16538	588 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PIGK	Q92643	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	CYP4B1	P13584	511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	AKR1A1	P14550	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	BMP5	P22003	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PGM1	P36871	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SOX2	P48431	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MVD	P53602	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	VAMP2	P63027	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TUBA4A	P68366	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MPP1	Q00013	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	GALNT2	Q10471	571 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	IP6K1	Q92551	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MROH8	Q9H579	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	METTL18	O95568	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	PLAU	P00749	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	CD4	P01730	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TARBP1-208	ENST00000484454	CD72	P21854	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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