RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482072.1

ABCA9-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 3

Gene ABCA9, Length 235 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-205	ENST00000482072	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	MROH8	Q9H579	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072		H7C1Q1	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	FIBP	O43427	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	EXOC3	O60645	756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	USP12	O75317	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	GCAT	O75600	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PDE8B	O95263	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	TGM2	P21980	687 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	FPR3	P25089	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	STAT1	P42224	750 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	STAT6	P42226	847 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	VPS41	P49754	854 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	DSCR3	O14972	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	JTB	O76095	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	CNTN5	O94779	1100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SGPL1	O95470	568 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ADH4	P08319	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ACADM	P11310	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PEPD	P12955	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	ALOX12	P18054	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	DRD4	P21917	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PRPH2	P23942	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	HNF1B	P35680	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	GGT5	P36269	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	MPL	P40238	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ABCA9-205	ENST00000482072	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms