RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 FAM129BQ96TA1 746 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 HPSEQ9Y251 543 aa8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ACSL4O60488 711 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 RHOBTB3O94955 611 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 IGLV3-27P01718 113 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 FYNP06241 537 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ITGAVP06756 1048 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CMA1P23946 247 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 SLC8A1P32418 973 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 GTF2H1P32780 548 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CSKP41240 450 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 NUMBP49757 651 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 RGS7P49802 495 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 C21orf59P57076 290 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 DAOAP59103 153 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 PTK2Q05397 1052 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ENPEPQ07075 957 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 DPYDQ12882 1025 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 NUMA1Q14980 2115 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CBWD6Q4V339 395 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 PKDCCQ504Y2 493 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 PMF1Q6P1K2 205 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 USP30Q70CQ3 517 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 UBR7Q8N806 425 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF511Q8NB15 262 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 FIBINQ8TAL6 211 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 TFAP2BQ92481 460 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.76□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 E9PAM4 449 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 O00370 1275 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 DFNA5O60443 496 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 LATS1O95835 1130 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CD19P15391 556 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CD38P28907 300 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ABCG1P45844 678 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 ACADVLP49748 655 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFA8P51970 172 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 METAP1P53582 386 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 SH3BP2P78314 561 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 LRMPQ12912 555 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 RTP5Q14D33 572 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CST6Q15828 149 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 LINC01559Q495D7 138 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 SGO2Q562F6 1265 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 MPP7Q5T2T1 576 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 HES3Q5TGS1 186 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 PCSK4Q6UW60 755 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 MFN1Q8IWA4 741 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 APCDD1Q8J025 514 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 STK40Q8N2I9 435 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 AADATQ8N5Z0 425 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA1Q92805 767 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 PTPRN2Q92932 1015 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-208ENST00000479480 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms