RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 ZNF670Q9BS34 389 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 AMFRQ9UKV5 643 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 CA14Q9ULX7 337 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 CCDC66A2RUB6 948 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 LRRD1A4D1F6 860 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 ZNF487B1APH4 448 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 KRT1P04264 644 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 STARD6P59095 220 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 AMPD2Q01433 879 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 PRKCQQ04759 706 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 MMRN1Q13201 1228 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 KRT81Q14533 505 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 MFN1Q8IWA4 741 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 EDAQ92838 391 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 TECTAO75443 2155 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ARL4AP40617 200 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 DGKGP49619 791 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CDH18Q13634 790 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SIX5Q8N196 739 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 KCTD6Q8NC69 237 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 EXD1Q8NHP7 514 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CALN1Q9BXU9 219 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 KLC2Q9H0B6 622 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 DEC1Q9P2X7 70 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 A0A0A0MRY4 1105 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 DCLK1O15075 740 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ERCC2P18074 760 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CD70P32970 193 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CDKN2BP42772 138 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MAPKAPK2P49137 400 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 GALK1P51570 392 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 LMAN2Q12907 356 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 GEN1Q17RS7 908 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PQLC3Q8N755 202 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 TERB1Q8NA31 727 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 FAM3CQ92520 227 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ALG14Q96F25 216 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PNKPQ96T60 521 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 TLR10Q9BXR5 811 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 H0Y626 953 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 MAN2B1O00754 1011 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 KIF5CO60282 957 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 CD72P21854 359 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 AMPD1P23109 780 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 OR1E1P30953 314 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 RWDD2BP57060 319 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 KDSRQ06136 332 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 PON2Q15165 354 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 AFMIDQ63HM1 303 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-210ENST00000477812 TMEM215Q68D42 235 aa20.49■□□□□ 0.87
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