RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PPM1NQ8N819 430 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TEKT5Q96M29 485 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LGMNQ99538 433 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 IL12RB2Q99665 862 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 EPAS1Q99814 870 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ECT2Q9H8V3 914 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 RGS18Q9NS28 235 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 COMMD8Q9NX08 183 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 OSER1Q9NX31 292 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PADI3Q9ULW8 664 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 VWA8A3KMH1 1905 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM72CH0Y354 149 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CAPN9O14815 690 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SYN3O14994 580 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LRIG2O94898 1065 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ATP6V1G2O95670 118 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PRKCGP05129 697 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 POLBP06746 335 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MYL4P12829 197 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CCNCP24863 283 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PSMB4P28070 264 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GP5P40197 560 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GRIA1P42261 906 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MAGEA11P43364 429 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CDK7P50613 346 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LIMK2P53671 638 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TPI1P60174 286 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 COG7P83436 770 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TBCCQ15814 346 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GRTP1Q5TC63 336 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAXCQ5TGI0 409 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CLEC14AQ86T13 490 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LINC00523Q86TU6 105 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TAC4Q86UU9 113 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM72BQ86X60 149 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 METTL23Q86XA0 190 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MPP5Q8N3R9 675 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 NPWQ8N729 165 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 STKLD1Q8NE28 680 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 KLHL29Q96CT2 875 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ERP27Q96DN0 273 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CERS2Q96G23 380 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CFAP36Q96G28 342 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SLC39A13Q96H72 371 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 C8orf48Q96LL4 319 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 C1orf74Q96LT6 269 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FCRL5Q96RD9 977 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 RBBP8Q99708 897 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CPNE1Q99829 537 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MED10Q9BTT4 135 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 KIFC1Q9BW19 673 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 IL22Q9GZX6 179 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms