RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 H0Y3Z8 333 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 TRMOQ9BU70 441 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 PDE11AQ9HCR9 933 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 TXNRD2Q9NNW7 524 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.56□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 DPPA5A6NC42 116 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 GRM8O00222 908 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 KRT38O76015 456 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 CIITAP33076 1130 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 ME1P48163 572 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 CDK7P50613 346 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 POSTNQ15063 836 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 RUBCNQ92622 972 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 HMCESQ96FZ2 354 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 THSD1Q9NS62 852 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.55□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 A0A0G2JK05 382 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 RHODO00212 210 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 NBNO60934 754 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 IGKV2-30P06310 120 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 PCP4P48539 62 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 ADPRHP54922 357 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 SYT13Q7L8C5 426 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 DDIASQ8IXT1 998 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.54□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 MCIDASD6RGH6 385 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 TCEA3O75764 348 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 CDK18Q07002 472 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 CUL4BQ13620 913 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 GALNT3Q14435 633 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 ERAP2Q6P179 960 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 ARRDC3Q96B67 414 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 IL21RQ9HBE5 538 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 ARL15Q9NXU5 204 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 BAG5Q9UL15 447 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.53□□□□□ -1.2
SGCE-210ENST00000472326 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 A6NNC1 897 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 E7EVH7 732 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 BMP15O95972 392 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 CHRNB1P11230 501 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 LYL1P12980 280 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PRPH2P23942 346 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB16Q05516 673 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PRKG1Q13976 671 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 DLGAP5Q15398 846 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA1Q92805 767 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 KCNJ9Q92806 393 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PIGSQ96S52 555 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.52□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 NDUFB8O95169 186 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PSG1P11464 419 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 GAD2Q05329 585 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 DCTN1Q14203 1278 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 NUGGCQ68CJ6 796 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 MMP21Q8N119 569 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 VPS52Q8N1B4 723 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 CCT6BQ92526 530 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 RILPL2Q969X0 211 aa7.51□□□□□ -1.21
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB9Q96C00 473 aa7.51□□□□□ -1.21
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