RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TSPAN3O60637 253 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MOSPD3O75425 235 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CNTN5O94779 1100 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GLP2RO95838 553 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ITGAVP06756 1048 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ETS1P14921 441 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CEBPBP17676 345 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGFBP4P22692 258 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC6A4P31645 630 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HTR7P34969 479 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IRAK1P51617 712 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GDF10P55107 478 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC7A9P82251 487 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AP1B1Q10567 949 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KCNC3Q14003 757 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ALFQ53S48 1182 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADGRF1Q5T601 910 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IFT20Q8IY31 132 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ALLCQ8N6M5 410 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCDC89Q8N998 374 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ITFG1Q8TB96 612 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BHMTQ93088 406 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGSF8Q969P0 613 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM161BQ96MY7 647 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LGMNQ99538 433 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERP44Q9BS26 406 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TASP1Q9H6P5 420 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDH22Q9UJ99 828 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LHX6Q9UPM6 363 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCL26Q9Y258 94 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLUHO75153 1309 aa6.6□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LEFTY2O00292 366 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DYNC1I1O14576 645 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KRT14P02533 472 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 POU2F2P09086 479 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RHOQP17081 205 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RBL1P28749 1068 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HOXC13P31276 330 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADCY8P40145 1251 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUMBP49757 651 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NRLP54845 237 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GRIN2CQ14957 1233 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDK1Q15118 436 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EFHBQ8N7U6 833 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLCO2A1Q92959 643 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OLFM3Q96PB7 478 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TDP1Q9NUW8 608 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SNX24Q9Y343 169 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.59□□□□□ -1.35
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRAMEF12O95522 483 aa6.59□□□□□ -1.36
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PFKLP17858 780 aa6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms