RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446903.5

TNS1-210, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-210ENST00000446903 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.2□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 OSER1Q9NX31 292 aa14.2□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.2□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 KCNK1O00180 336 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PITPNM1O00562 1244 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 GSTA2P09210 222 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 MLNP12872 115 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 HTRA3P83110 453 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 HDAC11Q96DB2 347 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 C8orf48Q96LL4 319 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 TRIM17Q9Y577 477 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 A0A1W2PQH9 124 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 NCAM2O15394 837 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 DCTN3O75935 186 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 APOEP02649 317 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 EPHB2P29323 1055 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 CYP2C18P33260 490 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SLC11A1P49279 550 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 DDR2Q16832 855 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 MANEALQ5VSG8 457 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ERP27Q96DN0 273 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 B3GALT6Q96L58 329 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SCML2Q9UQR0 700 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 CHKBQ9Y259 395 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 FGFR3P22607 806 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 HOXC13P31276 330 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 MAGEA11P43364 429 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 USP46P62068 366 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 FAAP100Q0VG06 881 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 STEAP4Q687X5 459 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 AGAP11Q8TF27 550 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SEPT8Q92599 483 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 HAPLN3Q96S86 360 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 TM9SF1O15321 606 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PAGE1O75459 146 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ABI1Q8IZP0 508 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 NUP93Q8N1F7 819 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 RNF34Q969K3 372 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 EBF2Q9HAK2 575 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 IL37Q9NZH6 218 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 TBC1D4O60343 1298 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 FAM155BO75949 473 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 VNN2O95498 520 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 MX2P20592 715 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 CCND1P24385 295 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ZBTB17Q13105 803 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PPP2R5DQ14738 602 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 PID1Q7Z2X4 250 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 BANPQ8N9N5 519 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.17□□□□□ -0.14
TNS1-210ENST00000446903 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms