RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TGFBIQ15582 683 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BROXQ5VW32 411 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KRT40Q6A162 431 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 IL31Q6EBC2 164 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PLD5Q8N7P1 536 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OR5T2Q8NGG2 359 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MCFD2Q8NI22 146 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM172AQ8WUF8 416 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FATE1Q969F0 183 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PGM2Q96G03 612 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf16Q9BUW7 83 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AGXT2Q9BYV1 514 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CMTM6Q9NX76 183 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ENTPD4Q9Y227 616 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NR2E1Q9Y466 385 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZHX2Q9Y6X8 837 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AURKAO14965 403 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RIMBP2O15034 1052 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EGFRP00533 1210 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HMGCRP04035 888 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 IL7P13232 177 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EDN3P14138 238 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PSMB9P28065 219 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA6P43360 314 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MADCAM1Q13477 382 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SEC23BQ15437 767 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 UBXN11Q5T124 520 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DDI2Q5TDH0 399 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 USP43Q70EL4 1123 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF614Q8N883 585 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OR8K5Q8NH50 307 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NXNL1Q96CM4 212 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 POM121Q96HA1 1249 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CRELD1Q96HD1 420 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PHB2Q99623 299 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GON7Q9BXV9 100 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DGCR6LQ9BY27 220 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EXD2Q9NVH0 621 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CPA4Q9UI42 421 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MAST3O60307 1309 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TBX10O75333 385 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 APOC3P02656 99 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BPIFB3P59826 476 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GRB14Q14449 540 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LPCAT4Q643R3 524 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PAGE2Q7Z2X7 111 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DNAAF5Q86Y56 855 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf107Q8IVU9 208 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-209ENST00000442510 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GINS2Q9Y248 185 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GDAQ9Y2T3 454 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 A6NL46 340 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC53A6NM62 1247 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 F8W036 122 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TXNL1O43396 289 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DFNA5O60443 496 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KERAO60938 352 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RFPL2O75678 378 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OR2B3O76000 313 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DHFRP00374 187 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 A1BGP04217 495 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 UGT2B4P06133 528 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RB1P06400 928 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PGK2P07205 417 aa5.7□□□□□ -1.5
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