RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.2■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.2■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.2■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.2■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1B0GVM2 712 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 UCHL3P15374 230 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 CYP11B1P15538 503 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 NOS2P35228 1153 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ST3GAL2Q16842 350 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 FBXL22Q6P050 247 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PIP4P1Q86T03 277 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ERICH1Q86X53 443 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 KDM1BQ8NB78 822 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 OMDQ99983 421 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SIK2Q9H0K1 926 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SGK2Q9HBY8 427 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.19■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ACACBO00763 2458 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 CD59P13987 128 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SPINK2P20155 84 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 GGCXP38435 758 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 MATKP42679 507 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SULT1E1P49888 294 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 CENPCQ03188 943 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 MTA1Q13330 715 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SLC12A1Q13621 1099 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 C18orf8Q96DM3 657 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 VPS16Q9H269 839 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 GAREM1Q9H706 876 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SCML1Q9UN30 329 aa20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1W2PP55 124 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 MID1O15344 667 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SH3BP5O60239 455 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 CER1O95813 267 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PSMD8P48556 350 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 OXCT1P55809 520 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SULT2A1Q06520 285 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 SLC14A1Q13336 389 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 TEAD4Q15561 434 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 CST6Q15828 149 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ACCSLQ4AC99 568 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 IGSF8Q969P0 613 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 BIRC7Q96CA5 298 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 WDCPQ9H6R7 721 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 RRN3Q9NYV6 651 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1B0GVT2 93 aa20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 PAGE1O75459 146 aa20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 C2CD6Q53TS8 623 aa20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 USP30Q70CQ3 517 aa20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 STK40Q8N2I9 435 aa20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NPAS1-201ENST00000439365 STK33Q9BYT3 514 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms