RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 TAF5Q15542 800 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 USP30Q70CQ3 517 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 BECN2A8MW95 431 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 F5H5T6 163 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 MID1O15344 667 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 FLRT2O43155 660 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 ECT2LQ008S8 904 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 APBA1Q02410 837 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 ARID5BQ14865 1188 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 CST6Q15828 149 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 CAMK4Q16566 473 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 LAYNQ6UX15 382 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 GBP6Q6ZN66 633 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 GLRX5Q86SX6 157 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 APCDD1Q8J025 514 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 COX16Q9P0S2 106 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 A0A1W2PP55 124 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 IGHV4-34P06331 123 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 CDK17Q00537 523 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 PASD1Q8IV76 773 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 RNF34Q969K3 372 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 CPXM1Q96SM3 734 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 OMDQ99983 421 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 DDIT4Q9NX09 232 aa20.15■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.14■□□□□ 0.82
CCDC189-201ENST00000433909 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 KCNK3O14649 394 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC2A3P11169 496 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ABCB4P21439 1286 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC8A1P32418 973 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PSMD8P48556 350 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 NUMBP49757 651 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GALCP54803 685 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 DEFB106AQ8N104 65 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SHC3Q92529 594 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CDC6Q99741 560 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.14■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 LRRC72A6NJI9 287 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GRAP2O75791 330 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GLI1P08151 1106 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PDGFRAP16234 1089 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CCR1P32246 355 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 NNMTP40261 264 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CCT8P50990 548 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 C21orf59P57076 290 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 STK40Q8N2I9 435 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 IGSF8Q969P0 613 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC6A18Q96N87 628 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 NOX5Q96PH1 765 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 FAM129BQ96TA1 746 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 FZD4Q9ULV1 537 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 A0A1B0GVM2 712 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 A0A1W2PPC4 97 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms