RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 ATP2A3Q93084 1043 aa28.33■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 CERS2Q96G23 380 aa28.33■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 TRIM62Q9BVG3 475 aa28.33■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 LRRC40Q9H9A6 602 aa28.33■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 ZFATQ9P243 1243 aa28.33■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa28.33■■■□□ 2.13
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CERS1-201ENST00000429504 CES4AQ5XG92 561 aa28.32■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 KCTD11Q693B1 232 aa28.32■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 OR52K1Q8NGK4 314 aa28.32■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 TRIB2Q92519 343 aa28.32■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 PKMYT1Q99640 499 aa28.32■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 PSAT1Q9Y617 370 aa28.32■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 KRT72Q14CN4 511 aa28.31■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 BEND5Q7L4P6 421 aa28.31■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 TAC4Q86UU9 113 aa28.31■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 A0A0U1RQF3 1178 aa28.31■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 THPOP40225 353 aa28.31■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa28.31■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 TXNDC16Q9P2K2 825 aa28.31■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 ARL8BQ9NVJ2 186 aa28.3■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 ZBTB17Q13105 803 aa28.29■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 OSBPL2Q9H1P3 480 aa28.29■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 EMCNQ9ULC0 261 aa28.29■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 IGLV3-25P01717 112 aa28.28■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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CERS1-201ENST00000429504 ADAM28Q9UKQ2 775 aa28.28■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 SNX10Q9Y5X0 201 aa28.28■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 CALB2P22676 271 aa28.28■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 ISL2Q96A47 359 aa28.28■■■□□ 2.12
CERS1-201ENST00000429504 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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