RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.34	□□□□□ -0.59
UBXN7-205	ENST00000429160	AP5Z1	O43299	807 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ADCY5	O95622	1261 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CD70	P32970	193 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	IL12RB1	P42701	662 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CLCN6	P51797	869 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	LMNB2	Q03252	620 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PLK5	Q496M5	336 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	P2RY11	Q96G91	374 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160		E9PAM4	449 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ADRA1B	P35368	520 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CSK	P41240	450 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CSRP2	Q16527	193 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	VSTM4	Q8IW00	320 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	BHMT	Q93088	406 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		11.33	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ILVBL	A1L0T0	632 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM24	O15164	1050 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	RHOQ	P17081	205 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	TRNP1	Q6NT89	227 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6	4e-7	■■■□□ 14.8
UBXN7-205	ENST00000429160	RHOC	P08134	193 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	L1CAM	P32004	1257 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPRN	Q16849	979 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	EFHC2	Q5JST6	749 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR59	Q6PJI9	974 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	WASH4P	A8MWX3	477 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	GYPC	P04921	128 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	NDUFV2	P19404	249 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	PRKCH	P24723	683 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	USP30	Q70CQ3	517 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CNGA4	Q8IV77	575 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	IGSF8	Q969P0	613 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.32	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CCP110	O43303	1012 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	EPHX1	P07099	455 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ACADM	P11310	421 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	CEP76	Q8TAP6	659 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF653	Q96CK0	615 aa		11.31	□□□□□ -0.6
UBXN7-205	ENST00000429160	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.31	□□□□□ -0.6

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