RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428982.4

SYNGAP1-203, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SYNGAP1, Length 4,339 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1-203ENST00000428982 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 COL4A1P02462 1669 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 A8MU76 341 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 EVPLLA8MZ36 301 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 KRT20P35900 424 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 EPN2O95208 641 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 GPS1Q13098 491 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 EPC2Q52LR7 807 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 HORMAD1Q86X24 394 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 FAR2Q96K12 515 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 FAM25CB3EWG5 89 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 FAM25GB3EWG6 89 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 TM9SF1O15321 606 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 30.9
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SYNGAP1-203ENST00000428982 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 GCNT1Q02742 428 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 ART3Q13508 389 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 37.9
SYNGAP1-203ENST00000428982 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 SLCO2A1Q92959 643 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 TBX20Q9UMR3 447 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 A6NL46 340 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 UBL4AP11441 157 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 GNA15P30679 374 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 STAT5BP51692 787 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 XKR3Q5GH77 459 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 ELMOD1Q8N336 334 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 C12orf42Q96LP6 360 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 VPS11Q9H270 941 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 SLC9A3P48764 834 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 A0A1W2PQ72 361 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 RALAP11233 206 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 NAMPTP43490 491 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 RAD23AP54725 363 aa14.74□□□□□ -0.05
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SYNGAP1-203ENST00000428982 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 MORF4L2Q15014 288 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 STK11Q15831 433 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 BOLA3Q53S33 107 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 C4orf19Q8IY42 314 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 ATL1Q8WXF7 558 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 ISOC1Q96CN7 298 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 PGBD4Q96DM1 585 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 CENPXA8MT69 81 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNGAP1-203ENST00000428982 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
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