RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYGBP11216 843 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMS1P54277 932 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NNTQ13423 1086 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHBQ15464 509 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNGA2Q16280 664 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSCBQ5H9T9 825 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9orf64Q5T6V5 341 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXPE2Q96DL1 559 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NT5C1BQ96P26 610 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVW-1Q9UQF0 538 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLR6Q9Y2C9 796 aa13.64□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PR77 199 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC34A8MYJ7 566 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBX4O00257 560 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YKT6O15498 198 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOCS3O95396 460 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FYNP06241 537 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGAVP06756 1048 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCB4P21439 1286 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD38P28907 300 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC8A1P32418 973 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNF1BP35680 557 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCG1P45844 678 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMD8P48556 350 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FMO5P49326 533 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCR5P51681 352 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC63Q05C16 580 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ12Q14500 433 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF6Q58WW2 860 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP52Q8N1V2 620 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AADATQ8N5Z0 425 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAP25Q8TEE9 199 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KAT5Q92993 513 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A13Q96H72 371 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRELD1Q96HD1 420 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIS12Q9H081 205 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF3Q9NR23 364 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.63□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADH1BP00325 375 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK4P11802 303 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACADVLP49748 655 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADPRHP54922 357 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN6P56747 220 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC3Q13217 504 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf118Q5T5N4 469 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAC4Q86UU9 113 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM32Q8TC27 787 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM149B1Q96BN6 582 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP83Q9Y592 693 aa13.62□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT9AO14904 365 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMM2O15305 246 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SART1O43290 800 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALCAP01258 141 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOEP02649 317 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1SP09871 688 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JUPP14923 745 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOT1P17174 413 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5AR1P21730 350 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXPH1P58417 271 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECT2LQ008S8 904 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC45A4Q5BKX6 768 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHSY1Q86X52 802 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APCDD1Q8J025 514 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK40Q8N2I9 435 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EID2Q8N6I1 236 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR14C36Q8NHC7 312 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRN2Q92932 1015 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERAC1Q96JX3 654 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSDMAQ96QA5 445 aa13.61□□□□□ -0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM129BQ96TA1 746 aa13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms