RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RAD23B	P54727	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CDH8	P55286	799 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TBX4	P57082	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KRT83	P78385	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	COG7	P83436	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CDR2	Q01850	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	HYAL1	Q12794	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SPA17	Q15506	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SHD	Q96IW2	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-205	ENST00000420234	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234		F8VP50	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PPEF2	O14830	753 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CCL16	O15467	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	AKR1B10	O60218	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	HSF2BP	O75031	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CLEC3A	O75596	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ZBED1	O96006	694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ERBB2	P04626	1255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CYBB	P04839	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CKM	P06732	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	RHO	P08100	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MYL4	P12829	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	EPCAM	P16422	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CYP2F1	P24903	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	LMO2	P25791	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	GABRR2	P28476	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PRKCI	P41743	596 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SLC5A3	P53794	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	AIF1	P55008	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	RNF4	P78317	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CDK17	Q00537	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	KCNC3	Q14003	757 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ACAP1	Q15027	740 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CLUL1	Q15846	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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