RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 CUL2Q13617 745 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 MFN1Q8IWA4 741 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ZNF843Q8N446 348 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 RFFLQ8WZ73 363 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 PTPRN2Q92932 1015 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SLC39A13Q96H72 371 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CFAP45Q9UL16 551 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 FZD4Q9ULV1 537 aa14.76□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 LRRC72A6NJI9 287 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 PIK3R2O00459 728 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ASLP04424 464 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 VDRP11473 427 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 GOT1P17174 413 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ABCB4P21439 1286 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 DRD3P35462 400 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 HNF1BP35680 557 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SLC11A2P49281 568 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 RGS7P49802 495 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 NDUFA8P51970 172 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 METAP1P53582 386 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ADPRHP54922 357 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 TBX4P57082 545 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 PPP2CBP62714 309 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 PPP2CAP67775 309 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 APCDD1Q8J025 514 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 STK40Q8N2I9 435 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 GDF3Q9NR23 364 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 HESX1Q9UBX0 185 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 AK5Q9Y6K8 562 aa14.75□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CALCAP01258 141 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SETSIPP0DME0 302 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 PLA2G2AP14555 144 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CD19P15391 556 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 VAV1P15498 845 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ST8SIA6P61647 398 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 TLE3Q04726 772 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 PROX2Q3B8N5 592 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 DCAF6Q58WW2 860 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 IRGQQ8WZA9 623 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 FGF11Q92914 225 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SNX21Q969T3 373 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SKA1Q96BD8 255 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SERAC1Q96JX3 654 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 OMDQ99983 421 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.74□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 TRIM38O00635 465 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 YKT6O15498 198 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 BRINP1O60477 761 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 LTFP02788 710 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CKMT2P17540 419 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SYKP43405 635 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 PSMD8P48556 350 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ECT2LQ008S8 904 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ILKQ13418 452 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CNGA2Q16280 664 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ERICH1Q86X53 443 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 SARDHQ9UL12 918 aa14.73□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.72□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 CETN3O15182 167 aa14.72□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NFE4-201ENST00000420058 STX10O60499 249 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms