RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 HIPK4Q8NE63 616 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ITFG1Q8TB96 612 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 NELL1Q92832 810 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 FGF13Q92913 245 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PGBD1Q96JS3 809 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 B3GALT6Q96L58 329 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 C8orf49Q96NF6 230 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 MXRA8Q9BRK3 442 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 KMT5AQ9NQR1 393 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 RXFP3Q9NSD7 469 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 KNTC1P50748 2209 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 VWA8A3KMH1 1905 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 FREM2Q5SZK8 3169 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 MROH6A6NGR9 719 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 FRS3O43559 492 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 B4GALT3O60512 393 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 UBXN7O94888 489 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 CCNE2O96020 404 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF20P17024 532 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PAX3P23760 479 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 GPC3P51654 580 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 LIMK1P53667 647 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 CEP55Q53EZ4 464 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 MIB1Q86YT6 1006 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 HDAC10Q969S8 669 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-210ENST00000415055 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-210ENST00000415055 POFUT1Q9H488 388 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-210ENST00000415055 RSAD1Q9HA92 442 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-210ENST00000415055 PRSS50Q9UI38 385 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PADI4Q9UM07 663 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 DMTF1Q9Y222 760 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF462Q96JM2 2506 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 A0A087WZ62 844 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-210ENST00000415055 TAF4O00268 1085 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 KALRNO60229 2985 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF806P0C7X5 589 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC192P0DO97 292 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-210ENST00000415055 PDE1AP54750 535 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 USP41Q3LFD5 358 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 RNF220Q5VTB9 566 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 ERAP2Q6P179 960 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 TEPPQ6URK8 271 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 SRLQ86TD4 932 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 TTC7BQ86TV6 843 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 STK32CQ86UX6 486 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 LONP2Q86WA8 852 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-210ENST00000415055 CEP57Q86XR8 500 aa4.98□□□□□ -1.61
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