RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 ERLIN1O75477 346 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 HOXA9P31269 272 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 ITGA8P53708 1063 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 PWWP2AQ96N64 755 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 GCNAQ96QF7 691 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 TMEM51Q9NW97 253 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 CDH22Q9UJ99 828 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 CCL26Q9Y258 94 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.71■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 C1RP00736 705 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 SLC11A2P49281 568 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 KCNC3Q14003 757 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 GPR158Q5T848 1215 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 LRRC31Q6UY01 552 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 ART4Q93070 314 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.7■□□□□ 0.91
ODC1-202ENST00000405333 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 KCNK1O00180 336 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 DFFAO00273 331 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 GALNT2Q10471 571 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 PDK1Q15118 436 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 RTL10Q7L3V2 364 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 ING5Q8WYH8 240 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 P2RY11Q96G91 374 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 APOL5Q9BWW9 433 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 DRGXA6NNA5 263 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 F5H5T6 163 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 TSPAN3O60637 253 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 XYLBO75191 536 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 HTR7P34969 479 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 RIN3Q8TB24 985 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 RTP4Q96DX8 246 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 PRO3102Q9H379 93 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 WHRNQ9P202 907 aa20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 F5H423 210 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 LINC01565O15544 149 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 SERPINB6P35237 376 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 SLC7A9P82251 487 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 GAD2Q05329 585 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 FAXCQ5TGI0 409 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 GLP2RO95838 553 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 RHOQP17081 205 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 CALCOCO2Q13137 446 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 MAP9Q49MG5 647 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 ADGRF1Q5T601 910 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 AFMIDQ63HM1 303 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 FMO2Q99518 471 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.68■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 CFAP69A5D8W1 941 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 WASH4PA8MWX3 477 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 HACD1B0YJ81 288 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 RNF103O00237 685 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 SASH3O75995 380 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 CEBPBP17676 345 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 ITIH2P19823 946 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 CHKAP35790 457 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 WASHC5Q12768 1159 aa20.67■□□□□ 0.9
ODC1-202ENST00000405333 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.5 ms