RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 LSMEM2Q8N112 164 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 STK40Q8N2I9 435 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 CAAP1Q9H8G2 361 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DOCK9Q9BZ29 2069 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 KLRC4O43908 158 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 OPA1O60313 960 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 PPP6R2O75170 966 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 NEFLP07196 543 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 C5AR1P21730 350 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DRD3P35462 400 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 LSSP48449 732 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ERVPABLB-1P60509 514 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 FSCBQ5H9T9 825 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 TMC6Q7Z403 805 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 LURAP1LQ8IV03 231 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 KDM1BQ8NB78 822 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 TATDN2Q93075 761 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DPH1Q9BZG8 443 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MMRN2Q9H8L6 949 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEF1Q9HAY2 307 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC4Q9HBW1 653 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ASCL3Q9NQ33 180 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 UCKL1Q9NWZ5 548 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MTMR6Q9Y217 621 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SSUH2Q9Y2M2 353 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 PDXKO00764 312 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ACSL4O60488 711 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MYF5P13349 255 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 METAP1P53582 386 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ADIGQ0VDE8 80 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 PITRM1Q5JRX3 1037 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 NADSYN1Q6IA69 706 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 IQCHQ86VS3 1027 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 CARNMT1Q8N4J0 409 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRN2Q92932 1015 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 VCPIP1Q96JH7 1222 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DEPDC7Q96QD5 511 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 CISHQ9NSE2 258 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC13Q9NSE7 274 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 CYTH4Q9UIA0 394 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 CA5BQ9Y2D0 317 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ITIH6Q6UXX5 1313 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GVM2 712 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 IRAK2O43187 625 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEC1O60732 1142 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 CUTAO60888 179 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 CSO75390 466 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ADH1BP00325 375 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 IL1BP01584 269 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-27P01718 113 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 GIMD1P0DJR0 217 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DGKAP23743 735 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SLC8A3P57103 927 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 RPS24P62847 133 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 STAT4Q14765 748 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 OR4C6Q8NH72 309 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 FFAR2O15552 330 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 RTN2O75298 545 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SLC11A2P49281 568 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 KMT5BQ4FZB7 885 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SEMA4DQ92854 862 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 FAM131CQ96AQ9 280 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 OSBPL2Q9H1P3 480 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN16Q9UKR8 245 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DMTF1Q9Y222 760 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 K7ENP7 123 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CKMT1AP12532 417 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 VAV1P15498 845 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 CSRP3P50461 194 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 DAOAP59103 153 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 ECT2LQ008S8 904 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 OVGP1Q12889 678 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 POM121L1PQ3SYA9 428 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 MSANTD2Q6P1R3 559 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
HOXD12-201ENST00000404162 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms