RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNG2Q16589 344 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALFQ53S48 1182 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP52Q8N1V2 620 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC33Q8N5R6 958 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTC13Q8NBP0 860 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DRGXA6NNA5 263 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFSD11O43934 449 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPAN3O60637 253 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 VCPP55072 806 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRADDQ15628 312 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIPOR3Q96MK2 946 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB17Q9H0T7 212 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNPEPQ9ULA0 475 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF510Q9Y2H8 683 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DOCK4Q8N1I0 1966 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 E2F8A0AVK6 867 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SGSHP51688 502 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF77Q15935 545 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM78AQ5JUQ0 283 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPWQ8N729 165 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 NDFIP2Q9NV92 336 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DTLQ9NZJ0 730 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 LIASO43766 372 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 C5orf22Q49AR2 442 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 NLRP14Q86W24 1093 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 TP53INP2Q8IXH6 220 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMRP1Q8NCR6 262 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASB16Q96NS5 453 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 GDE1Q9NZC3 331 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 WEE1P30291 646 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS24P62847 133 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 USP4Q13107 963 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 NOMO1Q15155 1222 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM217AQ8IXS0 508 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC35B2Q8TB61 432 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEC14L1Q92503 715 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERP44Q9BS26 406 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 POMKQ9H5K3 350 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDH7Q9ULB5 785 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 NFU1Q9UMS0 254 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHOQP17081 205 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 VIPR2P41587 438 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR153Q6NV75 609 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRN4Q8WUT4 740 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMARCD2Q92925 531 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLCO2A1Q92959 643 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSPRY1Q96DX4 576 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC3BQ96PB8 259 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLC2Q9H0B6 622 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 C10orf88Q9H8K7 445 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 WASH4PA8MWX3 477 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3BQ06 376 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ECEL1O95672 775 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCF3P15923 654 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTHFRP42898 656 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 NR2C2P49116 596 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CUL1Q13616 776 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 RABGAP1LQ5R372 815 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 GUCD1Q96NT3 240 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYADMQ96S97 322 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM31Q9BZY9 425 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPH5Q9H2P9 285 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM248Q9NWD8 314 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 MCF2LO15068 1137 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUPD1Q68J44 220 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF9Q9HAQ2 790 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD207Q9UJ71 328 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 GFRA2O00451 464 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINB6P35237 376 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 DEFB123Q8N688 67 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATL2Q8NHH9 583 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRK7Q8WTQ7 553 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC114Q96M63 670 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM114A2Q9NRY5 505 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF212Q9UDV6 495 aa28.48■■■□□ 2.15
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