RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 SEPT4O43236 478 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 PIRTP0C851 137 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC44A4Q53GD3 710 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ITIH5Q86UX2 942 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 OR10G6Q8NH81 332 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SH3GL1Q99961 368 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 DSEQ9UL01 958 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ERN1O75460 977 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 NTRK1P04629 796 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 TPBGLP0DKB5 382 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 PKNOX1P55347 436 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 FIBCD1Q8N539 461 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 WHRNQ9P202 907 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 PEX5P50542 639 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 CCNIQ14094 377 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 CNGA2Q16280 664 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ADAM2Q99965 735 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 CYLDQ9NQC7 956 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ZMPSTE24O75844 475 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 GAD1Q99259 594 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 DPP7Q9UHL4 492 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 PIK3CDO00329 1044 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 PROSCO94903 275 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SERPINF2P08697 491 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 NPY2RP49146 381 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 DLG4P78352 724 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 PFKPQ01813 784 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ELMO1Q92556 727 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 BRD9Q9H8M2 597 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SEPT3Q9UH03 358 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 CES2O00748 559 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 F9P00740 461 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 GJB1P08034 283 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 CD151P48509 253 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 TAF13Q15543 124 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 INSCQ1MX18 579 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 EXOC2Q96KP1 924 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SERHLQ9NQF3 203 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 E5RJQ4 531 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 METTL7BQ6UX53 244 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 NDNQ99608 321 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 COMMD8Q9NX08 183 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 FFAR3O14843 346 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 GPR42O15529 346 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 RAB14P61106 215 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ADI1Q9BV57 179 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.99□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 MED14O60244 1454 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM153BP0C7A2 387 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ACRP10323 421 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ITGAXP20702 1163 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 BCL2L1Q07817 233 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM153CQ494X1 144 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 TTI2Q6NXR4 508 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 HGH1Q9BTY7 390 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 CCL16O15467 120 aa14.98□□□□□ -0.01
NOTCH4-201ENST00000375023 HOXA2O43364 376 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms