RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CEACAM7Q14002 265 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ZNF394Q53GI3 561 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 DCAF6Q58WW2 860 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 PIGGQ5H8A4 983 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 GPR180Q86V85 440 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TRIM50Q86XT4 487 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 RNF169Q8NCN4 708 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 BORCS5Q969J3 196 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 NEURL2Q9BR09 285 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CALN1Q9BXU9 219 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TRIM17Q9Y577 477 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CAPNS1P04632 268 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 GSTT2P0CG29 244 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 GSTT2BP0CG30 244 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ARL2P36404 184 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 VGLL4Q14135 290 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TAF5Q15542 800 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 MGAT5BQ3V5L5 792 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 WDR78Q5VTH9 848 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 OGFOD2Q6N063 350 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 C16orf89Q6UX73 402 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 THNSL1Q8IYQ7 743 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 C17orf50Q8WW18 174 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 COG4Q9H9E3 785 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 OLAHQ9NV23 265 aa17.2■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 STAM2O75886 525 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 APRTP07741 180 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TMED10P49755 219 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ATP1A4Q13733 1029 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TAZQ16635 292 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 LY6KQ17RY6 165 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 GPR141Q7Z602 305 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CARM1Q86X55 608 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CENPSQ8N2Z9 138 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 KYQ8NBH2 561 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 KCTD6Q8NC69 237 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TMEM79Q9BSE2 394 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CDC14AQ9UNH5 594 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 FAM159BA6NKW6 160 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 DGKIO75912 1065 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 RPL10P27635 214 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CLDN10P78369 228 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ARL10Q8N8L6 244 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHA8Q96JA3 519 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 COQ10BQ9H8M1 238 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 SLC17A6Q9P2U8 582 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 USP2O75604 605 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CST3P01034 146 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 P4HA1P13674 534 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ZNF12P17014 697 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 RAB15P59190 212 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 MAP7D1Q3KQU3 841 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 GADL1Q6ZQY3 521 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 LRRC71Q8N4P6 559 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 DDHD1Q8NEL9 900 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 JOSD2Q8TAC2 188 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TRPC4APQ8TEL6 797 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 THAP11Q96EK4 314 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 PNPLA3Q9NST1 481 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 BCAP29Q9UHQ4 241 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 STYXL1Q9Y6J8 313 aa17.19■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 H7C0C1 242 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ATG7O95352 703 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 FGFR3P22607 806 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 GRK2P25098 689 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 PIK3R1P27986 724 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ATP5OP48047 213 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 SERPINB9P50453 376 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 STAT5BP51692 787 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 C21orf59P57076 290 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 TUBA4AP68366 448 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 HADHQ16836 314 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 MYO1HQ8N1T3 1032 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 FIBCD1Q8N539 461 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 NLGN2Q8NFZ4 835 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 DLG3Q92796 817 aa17.18■□□□□ 0.34
GDE1-201ENST00000353258 OR52B2Q96RD2 323 aa17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms