RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 TFDP2Q14188 446 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 NLRP14Q86W24 1093 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 OSBPL9Q96SU4 736 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 OSBPL8Q9BZF1 889 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 GTSE1Q9NYZ3 720 aa28.59■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PRLRP16471 622 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 AMPD1P23109 780 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 CXCR5P32302 372 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 RNF43Q68DV7 783 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 RFX6Q8HWS3 928 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 PCDH19Q8TAB3 1148 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 DNASE1L2Q92874 299 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 UNC80Q8N2C7 3258 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 MYO10Q9HD67 2058 aa28.58■■■□□ 2.17
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 FANCGO15287 622 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 MAPKAPK2P49137 400 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 CDH18Q13634 790 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 TMCO3Q6UWJ1 677 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 MFN1Q8IWA4 741 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 CARNMT1Q8N4J0 409 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 MYOFQ9NZM1 2061 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 H0Y626 953 aa28.57■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 DCLK1O15075 740 aa28.57■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 PFKPQ01813 784 aa28.57■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 AADACL2Q6P093 401 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 SAR1BQ9Y6B6 198 aa28.57■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 C6orf118Q5T5N4 469 aa28.56■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 LZTR1Q8N653 840 aa28.56■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 P2RY11Q96G91 374 aa28.56■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF212Q9UDV6 495 aa28.56■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 APOL1O14791 398 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 CEP104O60308 925 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 CACNG3O60359 315 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 LLGL1Q15334 1064 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 SLC9A4Q6AI14 798 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 PQLC3Q8N755 202 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 HEMGNQ9BXL5 484 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 SLC2A11Q9BYW1 496 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 SORCS3Q9UPU3 1222 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 TJP3O95049 919 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 OXCT1P55809 520 aa28.55■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa28.55■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa28.55■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 GJA4P35212 333 aa28.54■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa28.54■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 TTC8Q8TAM2 541 aa28.54■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF592Q92610 1267 aa28.54■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 ETNK2Q9NVF9 386 aa28.54■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 DUSP12Q9UNI6 340 aa28.54■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 BBS12Q6ZW61 710 aa28.53■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 DYNLT1P63172 113 aa28.52■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa28.52■■■□□ 2.16
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GIPC1-201ENST00000345425 COG1Q8WTW3 980 aa28.52■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO10Q9UK96 956 aa28.52■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC4EQ9ULY5 219 aa28.52■■■□□ 2.16
GIPC1-201ENST00000345425 ILVBLA1L0T0 632 aa28.51■■■□□ 2.15
GIPC1-201ENST00000345425 RAMP2O60895 175 aa28.51■■■□□ 2.15
GIPC1-201ENST00000345425 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
GIPC1-201ENST00000345425 RNF135Q8IUD6 432 aa28.51■■■□□ 2.15
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